COVID-19

La contribution d'Innoradiant à la recherche sur la Covid-19 :

AsI-Health, une plate-forme ouverte d'exploration des textes scientifiques relatifs au Covid.

Que propose AsI-Health ?

Nous croyons qu'au cours de cette période, les compétences et les expertises de chacun devraient être consacrées à contribuer à la bataille que l'humanité mène contre Covid-19. En ce qui nous concerne, la seule contribution que nous puissions apporter est en termes d'analyse sémantique des textes médicaux. Ainsi, nous avons travaillé dur pour fournir une application (AsI-Health) pour aider les scientifiques impliqués dans la recherche sur le Covid-19 à trouver un chemin à travers l'énorme quantité de littérature scientifique publiée quasi quotidiennement. Nous avons configuré notre technologie pour optimiser son efficacité sur des textes médicaux très spécifiques. Pour ce faire, nous l'avons enrichie avec un ensemble de logiciels open source (présentés ci-dessous) afin de fournir des analyse de la plus grande précision. L'idée fondatrice est d'offrir aux acteurs du domaine plus qu'un simple moteur de recherche textuel afin d'explorer la quantité de documentation disponible et d'en extraire les informations ou notions utiles à leur recherche sur le Covid-19. AsI-Health met en œuvre et étend les technologies de pointe en matière d'Open Information Extraction, afin de capturer les relations les plus saillantes exprimées dans des phrases et de relier les acteurs qui jouent un rôle dans ces relations.

News & Updates

- Integration of Elsevier Dataset (papers since 01/01/2020) 18/05/20
- New version with negated relations 18/03/2020
- The bioRxiv dataset was updated to 25/03/2020
- The bioRxiv dataset was updated to 14/04/2020

Quelles bases de données avons-nous utilisées ?


L'ensemble de données est en constante évolution. À ce jour, nous incluons toutes les prépublications liées à la Covid-19 et SARS-CoV-2 disponibles via bioRxiv. Les mises à jour sont effectuées régulièrement et systématiquement signalées dans le panneau «News and Updates». Inutile de dire qu'il s'agit des prépublications, qui donc n'ont pas nécessairement fait l'objet d'un examen par les pairs : comme écrit sur le site bioRxiv
“They should not be regarded as conclusive, guide clinical practice/health-related behavior, or be reported in news media as established information.”

Dans les prochains jours, la base de documents sera enrichie par les données traitant de la Covid-19 misent en libre accès par Elsevier dataset. Cet ensemble de documents est constitué d'articles publiés depuis 2010. Le choix de ce sous-ensemble est dû à une limitation des capacités de calcul et à une priorité donnée aux nouvelles informations. Au cours des prochaines semaines, nous espérons inclure également des contributions d'autres éditeurs, tels que Springer Nature | Wiley | NEJM | BMJ | American Society for Microbiology | American College of Cardiology| Chongqing VIP Information.

À qui s'adresse l'application ?

Nous voulons offrir à la recherche contre la Covid-19 les outils actuellement les plus performants du traitement automatique des langues. L'application est principalement destinée aux personnes impliquées dans la recherche et les expérimentations en cours dans ce domaine. Malheureusement, nous ne disposons pas de la puissance de calcul suffisante pour permettre un accès massif totalement illimité à l'application. En conséquence, nous proposons à toutes les personnes souhaitant utiliser l'application AsI-Health de nous contacter à l'adresse ci-dessous avec leur boite mail professionnelle. À réception nous vous transmettrons votre identifiant et mot de passe permettant un accès gratuit et illimité à la plateforme.

 

Comment contribuer ?

Il n'est pas facile pour nous de contacter tous les scientifiques impliqués dans la recherche contre la Covid-19. La meilleure contribution que vous puissiez apporter à cette initiative est donc simplement de faire circuler le lien vers cette page, dans l'espoir qu'elle parvienne à quelqu'un qui a vraiment besoin de l'application pour faire avancer ses conclusions.

Une autre contribution peut être apportée par les entreprises qui décident de parrainer cette initiative. Dans ce cas, nous leur proposerions de nous aider à construire une infrastructure plus réactive, à la fois en termes de fluidité de navigation (pour aider l'utilisateur à trouver les informations plus rapidement) et en termes de traitement en arrière-plan (afin d'intégrer plus de sources et d'effectuer des mises à jour plus régulièrement)

Sur qui s'appuie la plate-forme AsI ?

Nous présentons ci-dessous une liste non exhaustive de projets/logiciels sur lesquels nous nous sommes appuyés afin de rendre le traitement plus précis et «intelligent».

 

Stanford CoreNLP est utilisé pour le "dependency parsing"

Apache cTAKES™ est utilisé pour extraire les concepts médicaux de la littérature scientifique

Dexter est utilisé pour détecter les concepts entrant dans les relations et les désambiguïsant selon les concepts de Wikipedia

Kibana/Elastic est utilisé pour indexer toutes les informations extraites et explorer l'espace d'informations

Pour les questions d'ordre technique
Pour obtenir des identifiants d'accès ou proposer un parrainage